От обновленцев Средней Азии владыка приехал к обновленцам Сибири, вся Красноярская епархия была поражена этой болезнью. Бывший Иркутский епископ Зосима (Сидоровский) вышел из монашества, женился, и как только начался раскол в Церкви, был избран “большевистским” ВЦУ опять во епископы с новым именем Александр и назначен епископом Красноярским вместо отправленного на покой епископа Назария.
В Енисейске, куда вскоре после Красноярска отправили арестанта, все церкви были захвачены обновленцами-живоцерковниками. Что предпринял архиерей-узник? В допросах 1939 года сохранились доподлинные его слова: “Я открыто объявил себя единственно законным епископом Красноярским и Енисейским, согласно общей директивы патриарха Тихона”.
Есть в старинном Енисейске огибающая мужской Спасо-Преображенский монастырь дивная улица со старинными двухэтажными деревянными особняками. Прежде она называлась Ручейной, но давно уже носит имя одного из революционеров. Вот на этой улице, тогда еще Ручейной, и поселили епископа Луку с двумя ссыльными протоиереями. В этом красивом (до сих пор уцелевшем) доме была создана и освящена домашняя церковь, собравшая верующих Енисейска, обретших наконец такую желанную в то смятенное время твердую опору. Здесь владыка Лука рукоположил двоих - Александра Чурикова из псаломщиков в дьяконы, а выборного дьякона Николая Тюрнева в священники. Здесь рукоположил святитель в марте 1925 года сначала в иеродиаконы, а затем в иеромонахи некоего Христофора (Баушова).
Вот как вспоминал об этом сам владыка: “Почему же ты так остолбенел, увидев меня?” - спросил я у него. “Как же было не остолбенеть! - ответил он, - Десять лет тому назад я видел сон, который как сейчас помню. Мне снилось, что … неведомый мне архиерей рукополагает меня во иеромонаха. Сейчас, когда вы вошли, я увидел этого архиерея!” …Десять лет тому назад…я был земским хирургом в Переславле-Залесском и никогда не помышлял ни о священстве, ни об архиерействе. А у Бога в то время я уже был епископом”. После пострига иеромонах Христофор был направлен владыкой Лукой для служения в молитвенный дом Красноярска, поскольку все церкви там тоже были захвачены обновленцами, потом уехал на родину. На Урале в 1929 году был арестован и отправлен в ссылку. В архивах НКВД в одном из уголовных дел сохранилось так и не полученное Войно-Ясенецким письмо отца Христофора, где он пишет, как бедствует он в ссылке, просит владыку Луку выслать кое-что для служебной надобности, сухариков для подкрепления и свою фотокарточку.
В доме на улице Ручейной владыка Лука постриг в монахини бывших насельниц разоренного большевиками енисейского Иверского женского монастыря Черкашину и Верхотурову, поименовав одну в честь мирского своего имени Валентиной, а другую в честь святого своего имени Лукией. Как ангелы-хранители, они оставались рядом с ним в Енисейске, последовали со своим архипастырем далее в ссылку, а после Крайнего Севера вернулись с ним в Ташкент и там оставались рядом. Монахиня Валентина (Черкашина) даже жила в одном доме с Ясенецкими, помогала и по хозяйству, и принимать больных.
Популярности нового ссыльного архиерея в Енисейске способствовали чудодейственные операции, которые он делал в городской больнице. Слепые прозревали в полном смысле этого слова, больных, жаждущих исцеления, как и верующих на богослужениях на улице Ручейной, становилось все больше. Надзирателям из ОГПУ надо было что-то срочно делать с этой популярностью “попа”. Вскоре последовала новая ссылка через Богучаны в Хаю, возвращение в Енисейск, где видного узника, видимо, для острастки подержали несколько дней в камере-одиночке. Но, выйдя на волю, владыка вновь проповедовал, неся людям слово Божие. На этот раз в стенах Преображенского храма, позднее уничтоженного, а тогда его, видно, удалось забрать у обновленцев.
Именно на Преображение Господне 19 августа 1924 года начальник ГПУ по Восточной Сибири тов. Вольфрам, отправил срочную телеграмму своим соратникам в Енисейск: “Запретите Луке Ясенецкому служить в Храмах, поторопитесь высылкой в Туруханск”.